历史记载

　　清乾隆四十七年（1782）出版的《西域图志》称“额彬格逊淖尔”，清嘉庆年间（19世纪初）出版的《西域水道记》称“阿雅尔淖尔”，此名沿用至1951年出版的地图。1953年版《中华人民共和国分省新图》改称帖勒里湖，帖勒里一名系《西域水道记》对艾兰湖的称呼（原文称“特里淖尔”），系玛纳斯湖西南的小湖。直至1962年出版的《中华人民共和国分省地图集》才改称玛纳斯湖。玛纳斯湖为湖群中最大湖，形似鞋底，呈东北—西南向，长50公里，宽10～15公里，面积约550平方公里，湖面海拔257米，湖水补给原有玛纳斯、金沟、宁家等河，更早还有呼图壁河；有时还接纳准噶尔西部山地南部河流的洪水。20世纪50年代以来由于玛纳斯河中游大规模开垦，河水引入灌区，湖水已逐渐干缩，湖区绝大部分已结晶成盐。仅西南角偶有洪水入湖。艾兰湖位于玛纳斯湖西南，早已干涸，地表有盐结晶。据19世纪末外国考察者记载，当时艾兰湖有水，湖东岸曾有长约70公里的霍尔河（蒙古语意为咽喉河），1940年已干涸。艾里克湖在玛纳斯湖西北10公里，补给来自白杨河，由乌尔禾盆地穿过峡口而入；湖盆三面环山，西南开敞，东面受单面山阻隔，从地形与构造看，与玛纳斯湖似无联系。玛纳斯湖之东还有达巴松淖尔，为早已干涸之盐湖，已作盐场利用。 1964年地质工作者在湖盆北部乌尔禾一带采集到准噶尔翼龙（大型能飞行的爬行动物，生活于湖面，采食鱼虾）、克拉玛依恐龙、乌尔禾剑龙、鱼鳖等生物化石，这类生物生存于早白垩纪；根据岩石及动物群分析，当时湖盆周围为淡水湖泊。根据湖盆附近沉积物及阶地分布，第四纪时湖盆范围仍很大，第四纪初曾为乌伦古河尾闾。第四纪晚期以来，湖盆逐渐缩小，在沙丘间遗有许多盐湖。《西域图志》及《西域水道记》均推断阿雅尔湖与艾比湖过去可能联成一体，已为湖盆附近沉积物及阶地分布所证实。

　　发展

　　20世纪50年代末以来，由于玛纳斯两岸土地被开垦为耕地，发展灌溉农业 ，自玛纳斯河中游修建大量截水引水工程以后，除发生特大洪水有水流入湖区外，河水断流不再流入玛纳斯湖，20世纪70年代初完全干涸。

　　从上世纪80年代起，石河子玛纳斯河流域管理处夹河子水库逐年有计划地向下游玛纳斯湖注水，玛纳斯湖生态环境逐年提到了恢复。

　　1998年，重新形成湿地。2005年，湖面面积为123平方公里。

　　玛纳斯湖湿地的形成使石河子、克拉玛依、乌鲁木齐等地的生态环境好转，近几年北疆地区出现沙尘暴的频率明显减少。